Wie verbinde ich R mit MySQL oder wie installiere ich das RMySQL-Paket?

Es ist keine direkte Antwort, aber dennoch können Sie es hilfreich finden:

1. Verwenden Sie eine aktuellere Version von R (derzeit um 2.15)

2. Auf Windows-Plattformen würde ich den RODBC + Windows-MySQL-Treiber lieber verwenden, es sei denn, Sie befinden sich in einer Umgebung mit heterogenen Plattformen (z. B. Linux und Windows), in denen Code unter Teammitgliedern stark geteilt wird. Und selbst dann, wenn man zwischen RMySQL und RODBC im selben Skript wählt, hängt es von der Plattform ab, die es ausführt, ein einfaches if() {...} else {...}

Beachten Sie, dass ich nicht sage, dass es keine Erfolgsgeschichten mit dem gibt, was Sie zu tun versuchen, aber IMHO werden Sie früher mit dem oben genannten anfangen.

Sie können nun alle komplizierten Schritte überspringen und einfach install.packages("RMySQL")

Ich habe das über das Wochenende bei einem Hackathon auf Mac OSX erlebt - ich habe ganze vier Stunden gebraucht, um alles zusammenzustellen, obwohl ich ein paar Referenzmaterialien hatte (am Ende erwähnt). Ich fand keinen leichten Durchschlupf, also habe ich beschlossen, einen zu schreiben, solange es frisch ist.

Ich bin mir nicht sicher über die Kompatibilität mit Windows, aber hoffentlich werden diese Anweisungen es Ihnen auch leichter machen.

Ich habe versucht, R und MySQL in einer lokalen Umgebung zu kommunizieren (möglicherweise müssen für eine Serverumgebung Änderungen vorgenommen werden). Ich benutze XAMPP (obwohl ich RMySQL nicht für die Verbindung verwendet habe), aber am Ende konnte ich eine PHP-Seite verwenden, um eine R-Datei zu schreiben, diese Datei auszuführen und R in eine MySQL-Tabelle schreiben zu lassen. Soweit ich weiß, funktioniert das nur für MacOSX ...

Die gesamte verwendete Software war in DMG-Form, so dass keine Binärinstallation erforderlich ist.

1. Laden Sie herunter und führen Sie einige grundlegende Befehle aus, um sicherzustellen, dass es funktioniert.

2. In R müssen Sie RODBC installieren (falls Sie es noch nicht haben). Gib dies in die R-Konsole ein.

Dies installiert RODBC, aber seit OS Mavericks sind bestimmte Dateien nicht mehr enthalten, daher erhalten Sie eine Fehlermeldung

  

ODBC-Header sql.h und sqlext.h nicht gefunden

und Sie müssen die Dateien sql.h und sqlext.h an der richtigen Stelle ablegen.

Um dies am einfachsten zu machen, stellen Sie sicher, dass Sie homebrew installiert haben (einfache Anweisungen). Verwenden Sie dann diesen Code im Terminal, um die Installation durchzuführen.

Sobald das erledigt ist, gehst du noch einmal in die R-Konsole

3. Suchen Sie MySQL für die entsprechende ODBC-Installation . Ich benutze Mac OSX 10.6, also habe ich das dmg heruntergeladen und installiert. Dies hat sich von selbst erledigt.

4. Jetzt kommt der schwierige Teil. Anscheinend hat Mac OX den ODBC-Administrator nach einer kürzlich erschienenen OS-Version entfernt, also müssen Sie den ODBC-Manager herunterladen ( Ссылка ). Es ist auch eine DMG-Datei, also ziehen Sie sie einfach in Ihren Dienstprogramme-Ordner.

Ich hatte Schwierigkeiten mit der Installation von 5.3.6 dmg (wurde weiterhin fehlerhaft), daher habe ich stattdessen 5.2.7 installiert.

5. Öffnen Sie den ODBC-Manager. Sie müssen den DSN konfigurieren, klicken Sie also auf die Registerkarte "System DSN" und klicken Sie auf "Hinzufügen".

6. Sie erhalten ein Popup-Fenster, in dem Sie aufgefordert werden, einen Treiber auszuwählen. Meiner hatte "MySQL ODBC 5.2 Driver" basierend auf meiner MySQL ODBC Installation. OK klicken". Wenn Sie den Treiber nicht sehen, müssen Sie bestätigen, dass MySQL ODBC installiert ist.

7. Machen Sie im nächsten Popup-Fenster den Datenquellennamen (DSN) wie Sie wollen - aber denken Sie daran, dass dies der Name ist, den Sie zum Aufrufen von R verwenden müssen. Im folgenden Keyword-Bereich (Schlüsselwörter werden in Anführungszeichen gesetzt und der Wert wird in Klammern angegeben), ADD

   "Datenbank" (mit dem Wert Ihres Datenbanknamens)

   "server" (für die lokale Umgebung verwenden Sie nicht localhost - verwenden Sie stattdessen die lokale IP-Adresse 127.0.0.1. *** Dies war das KEY-Stück für mich)

   "uid" (Datenbankbenutzer-ID)

   "pwd" (Datenbankkennwort)

   "socket" (nicht sicher, ob dies erforderlich war, aber nach mehreren Tutorials war es in meiner Konfiguration und die Dinge funktionieren, also vielleicht brauchen Sie es. Sie finden Ihren Socket-Standort in my.cnf - führen Sie eine Spotlight-Suche durch. Der Speicherort der Socket-Datei befindet sich unter CLIENT)

   So sah meine Konfiguration aus:

   DSN ("test" - das war die Spitze)

   Datenbank ("Fernseher")

   socket ("/Applications/XAMPP/xamppfiles/var/mysql.sock")

   uid ("root")

   pwd ("")

   server ("127.0.0.1")

8. In R, führe unten aus - Ich glaube, dass diese letzten 3 Schritte jedes Mal ausgeführt werden müssen, wenn du R startest und bevor du eine MySQL-Abfrage machst.

   Bibliothek (RODBC)

9. Stellen Sie sicher, dass Sie MySQL und Apache über das XAMPP-Kontrollfeld aktiviert haben.

10. Dann führe

    aus

    odbcConnect ("test") - beachte, wie ich meinen DSN in Anführungszeichen gesetzt habe. Austausch wie nötig.

Dies sollte Sie zum Laufen bringen. Sie können weitere Anleitungen zum Erstellen von MySQL-Abfragen in R lesen.

Ich habe das aus einer Menge toller Beiträge auf Stack Overflow (danke alle!), zufälligen anderen Seiten / E-Mail-Austauschgeschichten und dem Buch "R in A Nutshell" von Joseph Adler gehackt, aber lass es mich wissen, wenn ich es verpasst habe etwas oder es ist unklar.

Viel Glück!

WENN DIESER FEHLER IN R

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