Wie verwenden Sie Ruby on Rails für die Wissenschaft (falls zutreffend)?

Wir forschen in der Systembiologie. Wir ziehen es vor, bestehende Datensätze zu verwenden, da das Sammeln neuer biologischer Daten teuer ist. Daher sind viele der Skripte, die wir schreiben, wenig mehr als Transformationen eines Datensatzes in einen anderen.

Schließlich stellen wir unsere Ergebnisse online - und mehr und mehr Journale verlangen so etwas.

Es war also kein großer Sprung für mich, Rails für meine Projekte zu verwenden. Ich kann leicht reproduzierbare Experimente erstellen, Daten Schritt für Schritt durch Datenbanktabellen (z. B. mit Rake) umwandeln und Ergebnisse mit Edelsteinen wie flotomatic und der gnuplot. Wenn ich etwas brauche, um sehr schnell zu laufen, kann ich sogar ein individuelles Juwel in C ++ mit Reis schreiben oder mit Starling und workling .

Irgendwann begann ich mich zu fragen, ob irgendjemand sonst Rails benutzt, um Bioinformatik oder Wissenschaft im Allgemeinen zu machen.

Ich dachte, "Wenn ich eine Wissenschaft Forschung Rails Edelstein wäre, was würde ich tun?"

Welche zusätzlichen Funktionen hätte solch ein Edelstein? Vielleicht eine Migrationsanpassung in eine rechenfähige Pipeline? Vielleicht erweiterte Grafikfunktionen? Integrierte Hintergrundjobs?