ape-phylo

___ tag123parallelprocessing ___ Parallelverarbeitung ist, im Gegensatz zu einer Concurrent-Verarbeitung, garantiert, dass alle Tasks auf Thread- und / oder Anweisungsebene, die parallel ausgeführt werden, gestartet / ausgeführt / beendet werden und eine garantierte Beendigung des gleichzeitig ausgeführten Code- Pfade. ___ tag123r ___ R ist eine freie, quelloffene Programmiersprache und Softwareumgebung für statistische Berechnungen, Bioinformatik, Visualisierung und allgemeine Datenverarbeitung. Stellen Sie minimale, reproduzierbare, repräsentative Beispiele für Ihre Fragen bereit. Verwenden Sie dput () für Daten und geben Sie alle Nicht-Basis-Pakete mit Bibliotheksaufrufen an. Bilder für Daten oder Code nicht einbetten, eingerückte Codeblöcke verwenden. Verwenden Sie für statistische Fragen http://stats.stackexchange.com. ___ qstnhdr ___ Berechnung von Morans I mit 4000 Datensätzen ___ tag123spdep ___ Ein R-Paket zur Bereitstellung von Funktionen für räumliche Regression, Abhängigkeit und Gewichtungsanalyse. ___ qstntxt ___

Ich habe 4000 Aufzeichnungen des Volumens in der Baumplantage. Ich muss die Moran's auf die ganze Plantage berechnen. Ich benutze die Bibliothek ape , weil spdep angeblich langsamer ist. Mein Code ist dies:

%Vor%

Wenn ich den Code ausführe, bekomme ich überlaufartige Fehler.

%Vor%

Verwenden der ff-Bibliothek

%Vor%

Weitere Fehlermeldungen:

%Vor%
  • Wie kann ich die Berechnung für die gesamte Plantage erhalten?

  • Soll ich sdep statt ape verwenden?

  • Wie konnte parallel die Bibliothek dieses Problem lösen?

Vielen Dank im Voraus Juan

    
___ tag123apephilo ___ Ape ist ein R-Paket zur Durchführung phylogenetischer Analysen und zum Zeichnen von phylogenetischen Bäumen. ___ answer18932196 ___

Sie haben einige unendliche Werte in Ihrer Matrix. Dies sollte in den 2 Fällen funktionieren (mit und ohne ff-Paket)

%Vor%

Anwenden mit einem kleinen Beispiel:

%Vor%     
___
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Antwort

Berechnung von Morans I mit 4000 Datensätzen

Ich habe 4000 Aufzeichnungen des Volumens in der Baumplantage. Ich muss die Moran's auf die ganze Plantage berechnen. Ich benutze die Bibliothek ape , weil spdep angeblich langsamer ist. Mein Code ist dies: %Vor% Wenn ich den Code ausführ...
21.09.2013, 11:35