biopython

Biopython ist eine Sammlung frei verfügbarer Werkzeuge für biologische Berechnungen, die in Python geschrieben wurden.
10
Antworten

Wie konvertiere ich die drei Buchstaben Aminosäurencodes in einen Buchstabencode mit Python oder R?

Ich habe eine Fasta-Datei wie unten gezeigt. Ich möchte die Drei-Buchstaben-Codes in einen Buchstabencode umwandeln. Wie kann ich das mit Python oder R machen? %Vor% gewünschte Ausgabe %Vor% Ihre Vorschläge würden geschätzt werden!   ...
06.10.2012, 13:39
1
Antwort

Traceback im Smith-Wateman-Algorithmus mit affiner Gap Penalty

Ich versuche, den Smith-Waterman-Algorithmus für die lokale Sequenzausrichtung unter Verwendung der affinen Gap-Penalty-Funktion zu implementieren. Ich denke, ich verstehe, wie man die Matrizen einleitet und berechnet, die für die Berechnung der...
07.08.2013, 10:32