bioinformatics

Wir forschen in der Systembiologie. Wir ziehen es vor, bestehende Datensätze zu verwenden, da das Sammeln neuer biologischer Daten teuer ist. Daher sind viele der Skripte, die wir schreiben, wenig mehr als Transformationen eines Datensatzes in e...

Ich versuche, den Smith-Waterman-Algorithmus für die lokale Sequenzausrichtung unter Verwendung der affinen Gap-Penalty-Funktion zu implementieren. Ich denke, ich verstehe, wie man die Matrizen einleitet und berechnet, die für die Berechnung der...

Programmiersprache: Python 3.4 Ich habe ein Programm für den Kurs Bioinformatik 1 von Coursera geschrieben. Das Programm funktioniert gut, ist aber für große Datensätze sehr langsam . Ich schätze, das liegt daran, dass die Schleife 4 x k mal...

Ich habe ein wissenschaftliches Datenverwaltungsproblem, das allgemein erscheint, aber ich kann keine existierende Lösung oder sogar eine Beschreibung davon finden, über die ich lange nachgedacht habe. Ich stehe kurz vor einer großen Neufassung...

Angenommen, ich habe eine DNA-Sequenz. Ich möchte die Ergänzung davon bekommen. Ich habe den folgenden Code verwendet, aber ich verstehe es nicht. Was mache ich falsch? %Vor%